中医子午流注在我国历史悠久，其理论基础在两千多年前的中医经典《黄帝内经》中就已经奠定，在中华民族传统医学的宝库中，是最具有特色的宝贵理论。
子午是指时辰，流是流动，注是灌注，子午流注理论是把一天24小时分为12时辰，对应十二地支，与人体十二脏腑的气血运行及五腧穴的开合进行结合,在一日十二时辰之中人体气血首尾相衔的循环流注，盛衰开合有时间节奏、时相特性。
子午流注开穴法来源于这样的规律，因时、因病、因人、因地从而准确、有效的调整患者气血，调理脏腑气血阴阳，在特定的时间点进行调理身体，恢复患者气血运行的正常时间规律，以达到治疗和预防疾病的目的。
血气应时而至为盛，血气过时而去为衰，逢时而开，过时为阖，泄则乘其盛，即经所谓刺实者刺其来。补者随其去，即经所谓刺虚者刺其去，刺其来迎而夺之，刺其去去随而济之，按照这个原则取穴，以取其更好的疗效，这就叫子午流注法。
人体脏腑经脉，六十六个经穴(五行穴)都配合阴阳五行，"时""日"天干也配合阴阳五行.因为人体是一个小天地，天地之气和人体之气是相应的，所以营卫之气在人体经脉中就有盛衰不同的时候，而五行又有生克的关系，相生,同气才能相应而合；相克，异气就不能相应而合。
所以十二"经的天干"逢到"日的天干"相同时，同气相应，这条经上的穴，只要"穴的五行"和"时的五行"相应,经气旺盛,这穴就"开"了。人身的疾病，归纳起来都是由气血偏胜偏衰和积滞不通所致，所以开穴时取此穴治病，效果最好。
